ຂ່າວ

mimicing ເງື່ອນໄຂທາງກາຍະພາບຊ່ວຍໃຫ້ນັກຄົ້ນຄວ້າຊອກຫາ binders ໂລຫະ

ນັກຄົ້ນຄວ້າໄດ້ພັດທະນາວິທີການກໍານົດໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍທີ່ຜູກມັດ ions ໂລຫະ. ion ໂລຫະແມ່ນມີຄວາມຈໍາເປັນໃນຊີວະສາດ. ແຕ່ການກໍານົດວ່າໂມເລກຸນໃດ - ແລະໂດຍສະເພາະໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍ - ທາດ ion ໂລຫະເຫຼົ່ານັ້ນພົວພັນກັບສາມາດທ້າທາຍໄດ້.

ເພື່ອແຍກ metabolites ສໍາລັບການວິເຄາະ, ວິທີການ metabolomics ທໍາມະດາໃຊ້ສານລະລາຍອິນຊີແລະ pH ຕ່ໍາ, ເຊິ່ງສາມາດເຮັດໃຫ້ສະລັບສັບຊ້ອນໂລຫະ dissociate. Pieter C. Dorrestein ຈາກມະຫາວິທະຍາໄລຄາລິຟໍເນຍ San Diego ແລະເພື່ອນຮ່ວມງານຕ້ອງການຮັກສາສະລັບສັບຊ້ອນຮ່ວມກັນສໍາລັບການວິເຄາະໂດຍການຈໍາລອງສະພາບພື້ນເມືອງທີ່ພົບຢູ່ໃນຈຸລັງ. ແຕ່ຖ້າພວກເຂົາໃຊ້ເງື່ອນໄຂທາງກາຍະພາບໃນລະຫວ່າງການແຍກໂມເລກຸນ, ພວກເຂົາຈະຕ້ອງໄດ້ປັບປຸງເງື່ອນໄຂການແຍກຕ່າງຫາກສໍາລັບແຕ່ລະສະພາບທາງສະລີລະວິທະຍາທີ່ພວກເຂົາຕ້ອງການທົດສອບ.

ແທນທີ່ຈະ, ນັກຄົ້ນຄວ້າໄດ້ພັດທະນາວິທີການສອງຂັ້ນຕອນທີ່ແນະນໍາສະພາບທາງຊີວະວິທະຍາລະຫວ່າງການແຍກ chromatographic ທໍາມະດາແລະການວິເຄາະ spectrometric ມະຫາຊົນ (Nat. Chem. 2021, DOI: 10.1038/s41557-021-00803-1). ຫນ້າທໍາອິດ, ພວກເຂົາເຈົ້າໄດ້ແຍກສານສະກັດຈາກຊີວະພາບໂດຍໃຊ້ chromatography ແຫຼວທີ່ມີປະສິດທິພາບສູງແບບດັ້ງເດີມ. ຫຼັງຈາກນັ້ນ, ພວກເຂົາເຈົ້າໄດ້ປັບ pH ຂອງການໄຫຼອອກຈາກຖັນ chromatographic ເພື່ອ mimic ສະພາບທາງກາຍະພາບ, ເພີ່ມ ions ໂລຫະ, ແລະວິເຄາະປະສົມກັບ spectrometry ມະຫາຊົນ. ພວກເຂົາເຈົ້າດໍາເນີນການວິເຄາະສອງຄັ້ງເພື່ອໃຫ້ໄດ້ spectra ມະຫາຊົນຂອງໂມເລກຸນຂະຫນາດນ້ອຍທີ່ມີແລະບໍ່ມີໂລຫະ. ເພື່ອກໍານົດວ່າໂມເລກຸນໃດຜູກມັດໂລຫະ, ເຂົາເຈົ້າໄດ້ໃຊ້ວິທີການຄໍານວນທີ່ນໍາໃຊ້ຮູບຮ່າງສູງສຸດເພື່ອ infer ການເຊື່ອມຕໍ່ລະຫວ່າງ spectra ຂອງສະບັບຜູກມັດແລະ unbound.

ວິທີຫນຶ່ງທີ່ຈະເຮັດຕາມເງື່ອນໄຂທາງກາຍະພາບຕື່ມອີກ, Dorrestein ເວົ້າວ່າ, ຈະເປັນການເພີ່ມຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງ ions ເຊັ່ນໂຊດຽມຫຼືໂພແທດຊຽມແລະຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຕ່ໍາຂອງໂລຫະທີ່ມີຄວາມສົນໃຈ. “ມັນກາຍເປັນການທົດລອງການແຂ່ງຂັນ. ໂດຍພື້ນຖານແລ້ວມັນຈະບອກທ່ານວ່າ, ຕົກລົງ, ໂມເລກຸນນີ້ພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂເຫຼົ່ານັ້ນມີແນວໂນ້ມທີ່ຈະຜູກມັດ sodium ແລະ potassium ຫຼືໂລຫະທີ່ເປັນເອກະລັກທີ່ເຈົ້າໄດ້ເພີ່ມ, "Dorrestein ເວົ້າ. "ພວກເຮົາສາມາດ infuse ໂລຫະທີ່ແຕກຕ່າງກັນຫຼາຍພ້ອມໆກັນ, ແລະພວກເຮົາສາມາດເຂົ້າໃຈຄວາມມັກແລະການຄັດເລືອກຢ່າງແທ້ຈິງໃນສະພາບການນັ້ນ."

ໃນສານສະກັດຈາກວັດທະນະທໍາຈາກ Escherichia coli, ນັກຄົ້ນຄວ້າໄດ້ກໍານົດທາດປະສົມທາດເຫຼັກທີ່ຮູ້ຈັກເຊັ່ນ yersiniabactin ແລະ aerobactin. ໃນກໍລະນີຂອງ yersiniabactin, ພວກເຂົາເຈົ້າຄົ້ນພົບວ່າມັນຍັງສາມາດຜູກມັດສັງກະສີ.

ນັກຄົ້ນຄວ້າໄດ້ກໍານົດທາດປະສົມໂລຫະໃນຕົວຢ່າງທີ່ຊັບຊ້ອນຄືກັບສານອິນຊີທີ່ລະລາຍຈາກມະຫາສະຫມຸດ. Dorrestein ກ່າວວ່າ "ນັ້ນແມ່ນຫນຶ່ງໃນຕົວຢ່າງທີ່ສັບສົນທີ່ສຸດທີ່ຂ້ອຍເຄີຍເບິ່ງ," Dorrestein ເວົ້າ. "ມັນອາດຈະເປັນສະລັບສັບຊ້ອນ, ຖ້າບໍ່ສະລັບສັບຊ້ອນຫຼາຍກ່ວານ້ໍາມັນດິບ." ວິທີການດັ່ງກ່າວໄດ້ກໍານົດອາຊິດ domoic ເປັນໂມເລກຸນທີ່ຜູກມັດທອງແດງແລະແນະນໍາວ່າມັນຜູກ Cu2+ ເປັນ dimer.

"ວິທີການ omics ເພື່ອກໍານົດ metabolites ຜູກມັດໂລຫະທັງຫມົດໃນຕົວຢ່າງແມ່ນເປັນປະໂຫຍດທີ່ສຸດເພາະວ່າຄວາມສໍາຄັນຂອງ chelation ໂລຫະທາງຊີວະພາບ," Oliver Baars, ຜູ້ທີ່ສຶກສາ metabolites ຜູກມັດໂລຫະທີ່ຜະລິດໂດຍພືດແລະຈຸລິນຊີທີ່ມະຫາວິທະຍາໄລ North Carolina State, ຂຽນໃນບົດຄວາມ. ອີເມວ.

Albert JR Heck, ຜູ້ບຸກເບີກໃນການວິເຄາະ spectrometry ມະຫາຊົນພື້ນເມືອງຢູ່ມະຫາວິທະຍາໄລ Utrecht, ຂຽນໃນອີເມວວ່າ "Dorrestein ແລະເພື່ອນຮ່ວມງານສະຫນອງຄວາມສະຫງ່າງາມ, ມີຄວາມຈໍາເປັນຫຼາຍ, ເພື່ອສືບສວນທີ່ດີກວ່າວ່າບົດບາດທາງດ້ານສະລີລະວິທະຍາຂອງ ions ໂລຫະຢູ່ໃນຈຸລັງແມ່ນຫຍັງ,". "ຂັ້ນຕອນຕໍ່ໄປທີ່ເປັນໄປໄດ້ແມ່ນການສະກັດເອົາທາດ metabolites ພາຍໃຕ້ສະພາບເດີມຈາກຈຸລັງແລະແຍກສ່ວນເຫຼົ່ານີ້ພາຍໃຕ້ເງື່ອນໄຂພື້ນເມືອງ, ເພື່ອເບິ່ງວ່າທາດ metabolites ບັນຈຸທາດ ions ຈຸລັງ endogenous ໃດ."

ຂ່າວເຄມີ ແລະວິສະວະກຳ
ISSN 0009-2347
ສະຫງວນລິຂະສິດ © 2021 American Chemical Society